Из своего опыта, можно использовать как одного плательщика для всех аккаунтов, так и разных (с разных юрлиц). Яндексу без разницы, как производится оплата — переводом или с карты, одним или несколькими лицами.
Оплата с разных юрлиц может быть удобна, если нужны отдельные счета по кампаниям.
Если важна упрощённая отчётность, то лучше оплачивать все аккаунты с одного юрлица — система автоматически формирует все необходимые отчётные документы.